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细胞壁是植物细胞最外部的亚细胞结构,是细胞感受和响应环境因子的第一道屏障. 细胞壁主要由纤维素、半纤维素和果胶、木质素和少量蛋白质构成[1]. 纤维素是植物细胞壁中最主要的结构多糖,约占植物干重的三分之一[2]. 纤维素分子为不分支的 β-1,4-葡聚糖链. 半纤维素的含量仅次于纤维素,约占干重的 35%[3],主要包括木聚糖、木葡聚糖、半乳葡萄甘露聚糖等等,其中木聚糖是植物细胞半纤维素的主要成分. 果胶是由半乳糖醛酸基通过 α-1,4-糖苷键相连而成的聚合物,包括半乳糖醛酸聚糖、鼠李半乳糖醛酸聚糖I、鼠李半乳糖醛酸聚糖II以及少量的木糖半乳糖醛酸聚糖等[4]. 木质素是由醇单体(如对香豆醇、松柏醇和芥子醇) 形成的酚类多聚物[5]. 木质素的疏水性极强,可增强植物细胞壁的机械强度[6].

植物细胞壁蛋白约占细胞壁总质量 5%~10%[7],然而其在细胞壁构建、信号转导和响应环境胁迫等中具有重要作用[8,9]. 植物细胞壁主要包含四类结构蛋白富含羟脯氨酸的糖蛋白、富含甘氨酸的蛋白质、富含苏氨酸和羟脯氨酸的糖蛋白与富含组氨酸和羟脯氨酸的糖蛋白[10]. 其中,富含羟脯氨酸的糖蛋白是植物细胞壁中存在的最大的结构蛋白超家族,根据糖基程度分为高度糖基化的阿拉伯半乳聚糖蛋白,适度糖基化的伸展蛋白和低糖基化富含脯氨酸蛋白[11]. 其中伸展蛋白是最早被发现的,也是迄今研究最为深入的. LRR 型伸展蛋白(LEUCINE-RICH REPEAT EXTENSIN, LRX) 含有 LRR 序列和伸展蛋白结构域,近年来的研究表明其通常参与蛋白之间的相互作用[12],也可作为酶活性的调节剂[13].

细胞壁是一个动态变化的复杂网络结构. 监测细胞壁的状态并保证其结构和功能完整性对于植物正常生长发育非常重要的. 当植物遭受非生物和生物胁迫时,其细胞壁完整性(cell wall integrity) 可能被损害[14]. 细胞壁-质膜系统可实时感知细胞壁的状态,进而引发细胞内发生一系列适应环境变化的代谢过程[15]. 这种感知过程是通过细胞内外的信号传递过程实现的. 由质膜上的蛋白激酶介导的信号传导系统在维持细胞完整性方面起着重要作用. 这些蛋白激酶包括细胞壁关联蛋白激酶(CELL WALL-ASSOCIATED KINASEWAK) 、富含亮氨酸重复的受体激酶(LEUCINE-RICH REPEAT RECEPTOR KINASE) 和长春花类受体激酶(CATHARANTHUS ROSEUS RECEPTOR-LIKE KINASE 1-LIKE, CrRLK1L) 蛋白,它们可结合植物细胞壁组分或激素,进而诱发下游防御反应[16,17,18,19]. CrRLK1L 家族成员 FERONIA(FER) 的胞外结构域可与果胶结合,也可与细胞壁蛋白 LRX 或细胞壁多肽激素快速碱化因子(rapid alkalinization factor, RALF) 相互作用[20,21]. 因此,LRX-RALF-FER 可能作为细胞壁完整性感受器(sensor) 和核心组分调控环境胁迫条件下植物的生长发育过程[22].

文献计量分析(bibiliometric analysis) 是指用数学和统计学的方法,定量探索某一科学研究领域发展的交叉科学. 其计量对象主要是文献量(各种出版物,期刊论文和引文) 、作者(个人或团体) 和关键词(各种文献标识)  [23]. CiteSpace 软件是目前知识图谱绘制和应用最广泛的可视化分析软件之一[24]. 通过 CiteSpace 可视化分析,可以清晰地呈现某个特定研究领域的发展脉络、合作关系,并能探索其知识基础与研究热点[25]. 本文基于 Web of Science(WoS) 核心合集数据库,以文献计量学为理论基础,运用 CiteSpace 可视化软件,对近 10 年来植物细胞壁的研究热点和知识基础进行可视化分析,从而探究该领域近 10 年的发展进程,寻找该领域的前沿热点,并为未来该领域的研究方向提供参考. 

1数据来源及研究方法

1. 1 数据来源及检索式

以国际公认的数据Web of Science(http//webofscience.com/) 作为数据来源,选择 Science Citation Index Expanded(SCI-E) ,时间跨度为 2011  2021 年,检索式为TS= (“cell wall” AND plant) ,文献类型为“Article”,语种为“English”,类别选择 “Plant Sciences”,检索时间为 2022  6  30 日,共检索到文献 4794 . 下载格式选择为全纪录与引用的参考文献,文件格式选择纯文本,下载保存后用于后续分析.

1. 2 研究方法

采用CiteSpace V进行可视化分析. 首先,以下载的文献数据对植物细胞壁研究领域进行发文特性、关键词时间线图谱和突现分析以及被引文献的共现分析,深入挖掘该领域近 10 年发展和研究的重要知识基础.

2结果与分析

2. 1 发文量与期刊分布分析

基于从 WOS 下载的 4794 篇文献的数据进行计量分析,得到与植物细胞壁相关的研究年发文数量变化趋势图. 由图 1可以看出在 2012  2021 年间年发文量较多且呈现逐年稳定增长的趋势,10 年内发文量增加接近一倍,说明植物细胞壁的研究为持续的热点领域,且最近 10 年处于该领域的稳定发展期,预计今后植物细胞壁研究领域的发文量仍将继续上升


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